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EUROSCARF 收集中心已建立，用于存放和交付基因組分析網絡中生成的生物材料。其中包括以下項目：BMBF（325 個 ORF）、EUROFAN I（800 個 ORF）和作為*酵母基因缺失項目（6000 個 ORF）一部分的 EUROFAN II。當可用時，含有缺失盒或互補基因的質粒也有庫存。缺失菌株的遺傳背景因項目而異。在許多情況下，您可以選擇不同的遺傳背景。 德國酵母功能分析項目 在 BMBF（Bundesministerium für Bildung und Forschung）支持的德國酵母功能分析項目（1994-1997）期間，325 個基因已被刪除。 15 個實驗室的合作致力于基因的缺失和缺失菌株的功能分析（Entian 等：Mol Gen Genet 262 (1999) 683-702）。所有缺失均在菌株 CEN.PK2 中完成。由于該項目的早期啟動，大多數基因缺失是通過用營養缺陷型標記替換感興趣的基因來實現的。大約三分之一的缺失是通過 PCR 技術進行的。出于這個原因，有多種轉化標記可以用來替換基因。從這個項目 EUROSCARF 擁有交配類型和雜合二倍體菌株的單倍體菌株。只有雜合二倍體可用于必需基因。該項目貢獻的菌株可以通過登錄號中的前 B 后跟 4 位數字代碼和終端字母來識別。 EUROFAN I |
115 個團體的合作得到了歐盟的支持。該項目始于 1/96，800 個開放閱讀框被刪除和分析。每個參與實驗室都負責刪
除和初步分析六個基因 (sixpack)。 Wach 等人已經制定了刪除策略。 (酵母 10 (1994) 1793-1808)。該策略基于 PCR 片段刪除相應的開放閱讀框。缺失存在于三種不同的遺傳背景中。必須刪除 FY1679 背景中的所有開放閱讀框，與 S288C 同基因，S288C 是釀酒酵母基因組測序的來源。除了大多數基因的缺失之外，在 CEN.PK2 或 W303 中還產生了一組額外的缺失，以證明缺失盒是普遍使用的。在第一階段構建的菌株通過登錄號中的 5 位數字代碼后跟對應于菌株交配類型的終端字母來標識。 根據EUROFAN I的指導方針，還收集了所有缺失質粒。除此之外，對于大多數基因，還有用于互補缺失基因的質粒。 *基因缺失項目（EUROFAN II） 在*范圍內，歐洲和海外實驗室聯合在 Saccharomyces 基因組缺失項目聯盟中（Winzeler 等人：Science 285 (1999) 901-906）。歐洲任務被標記為 EUROFAN II。所有構建的菌株將由 EUROSCARF 收集。缺失是在與 S288c（其 DNA 序列已確定的釀酒酵母菌株）同基因的遺傳背景中進行的。 II期構建的缺失菌株均在BY菌株系列的遺傳背景中。 這些菌株的 EUROSCARF 登錄號與 Saccharomyces 基因組刪除項目給出的記錄號僅通過前面的字母 Y 不同。 |
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